Управление школой осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации с учетом особенностей, установленных Федеральным законом «Об образовании в Российской Федерации», Уставом школы на принципах демократичности, открытости, приоритета общечеловеческих ценностей, охраны жизни и здоровья человека, свободного развития личности. Система управления осуществляется с учетом социально-экономических, материально-технических и внешних условий в рамках существующего законодательства РФ.
     Управление школой осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
     Единоличным исполнительным органом образовательной организации является директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью образовательной организации.
     В школе сформированы коллегиальные органы управления, к которым относятся общее собрание трудового коллектива МКОУ Панинской СОШ, педагогический совет, Управляющий совет.
     Структура, порядок формирования, срок полномочий и компетенция органов управления образовательной организацией, порядок принятия ими решений и выступления от имени образовательной организации устанавливаются уставом МКОУ Панинской СОШ в соответствии с законодательством Российской Федерации.
     Школьный коллектив, объединяющий учащихся и работников школы, осуществляет свои задачи в тесном взаимодействии с учредителем, собственником имущества, родителями (законными представителями) обучающихся и широкой общественностью.